Nové evoluční centroméry rostlin
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202300001
Hlavní účastníci
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
23-06840S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Evolutionary new centromeres in plants
Anotace anglicky
Centromeres are required for regular segregation of monocentric chromosomes. Centromere repositioning (CR) and evolutionary new centromeres (ENCs) refer to the formation of a centromere at a different position on the same chromosome. We hypothesize that the formation and maturation of ENC may influence the epigenetic landscape, transcription, and recombination, and secondarily contribute to reproductive isolation and speciation. The Arabideae tribe of the mustard family represents a group with the highest documented frequency of ENCs in plants. Improvements in long-read sequencing, coupled with algorithmic advances in genome assembly, now enable telomere-to-telomere genome assembly, including complex (peri)centromeric regions. We intend to analyze ENCs in Arabideae using long-read sequencing methods complemented by cytogenomic and epigenetic analyzes to investigate the structure of ENCs and the effects of CR on recombination, transcription, and reproductive isolation. The project results will provide new insights into the life cycle of complex plant centromeres.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10611 - Plant sciences, botany
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EF - Botanika
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2023
Ukončení řešení
31. 12. 2025
Poslední stav řešení
B - Běžící víceletý projekt
Poslední uvolnění podpory
24. 4. 2023
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
19. 2. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
12 446 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
12 446 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč