Genetická diverzita a fylogeneze rodu Acinetobacter v přírodních ekosystémech.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 17 (SGA0201300005)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut<br>Státní zdravotní ústav se sídlem v Praze

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

13-26693S

Název projektu anglicky

Genetic diversity and phylogeny of the genus Acinetobacter in natural ecosystems.

Anotace anglicky

The genus Acinetobacter is a ubiquitous group of physiologically and biochemically versatile bacteria. Despite the progress in the classification of acinetobacters from humans, very little is known about their diversity in the natural environment. To address this issue, we propose a project designed as an in-depth population genetic study based on a prospective collection of strains from different well-defined ecosystems. An approach based on MALDI-TOF MS profiling will be optimized to become a rapid and reliable tool for the identification of acinetobacters in primary culture. Strains of unknown taxonomic status will be also studied using multilocus sequence analysis, whole-genome comparison, and a wide range of phenotypic tests. The existing MALDI-TOF MS identification database will be continuously updated with reference entries from the taxonomic analysis of new isolates. The project is expected to improve essentially the knowledge of the Acinetobacter diversity and phylogeny at the species and strain levels and to provide a taxonomically precise basis for ecological studies.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

EH - Ekologie – společenstva

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt prokázal velkou taxonomickou rozmanitost rodu Acinetobacter v půdních a vodních ekosystémech. Výsledky mají praktické využití v medicínských oborech, ale jsou důležité i pro environmentální studie mikrobiomů a taxonomii bakterií. Z projektu vzniklo nadprůměrné množství publikací v renomovaných časopisech. Prostředky byly čerpány v souladu s pravidly GAČR.

Zahájení řešení

1. 2. 2013

Ukončení řešení

31. 12. 2016

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

12. 4. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP17-GA0-GA-U/03:1

Datum dodání záznamu

28. 6. 2017

Celkové uznané náklady

6 722 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 722 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč