Modifikace a bioorthogonální reakce ve velkém žlábku DNA pro regulaci vazby proteinů a genové exprese

Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Hlavní účastníci
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.<br>Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
14-04289S

Název projektu anglicky
Modifications and bioorthogonal reactions in the major groove of DNA for regulation of protein binding and gene expression
Anotace anglicky
Synthesis of novel base-modified oligonucleotides (ONs) and DNA bearing diverse modifications in major groove for conceptually novel applications in chemical biology will be pursued. The preparation of modified nucleic acids will be based on cross-coupling reactions of nucleoside triphosphates followed by enzymatic incorporation catalyzed by DNA polymerases. The diverse types of modifications will be studied as protecting groups for regulation (switching) of binding of proteins to DNA. The influence of an attachment of functional or protecting groups of variable bulkiness to the major groove of DNA on sequence-specific interactions with proteins (restriction endonucleases, methyltransferases, transcription factors etc.) and on in vitro transcription will be systematically studied. Transformations of these attached groups by bioorthogonal reactions will be used to regulate and switch these interactions and the corresponding biological processes (transcription).

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
CE - Biochemie
CEP - vedlejší obor
CC - Organická chemie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10401 - Organic chemistry<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods

Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Řešení projektu přineslo nové poznatky o ovlivňování transkripce pomocí chemické modifikace ve velkém žlábku DNA templátu. Řešitelé popsali vztah mezi typem modifikace a transkripční aktivitou. Výsledky projektu slibují zdárný rozvoj problematiky zaměřené na regulací interakce nukleových kyselin s proteiny.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Datum dodání záznamu
28. 6. 2017

Podobné projekty(10)