Úloha konformace DNA a žlábků DNA v rozpoznávání DNA proteiny. Modelové studie

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

—

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Role of DNA conformation and DNA grooves in protein - DNA recognition. Model studies.

Anotace anglicky

The goal of the project is to contribute to the elucidation of the rules governing the specific and selective binding of proteins to DNA with a special regard to the question of the influence of nucleotide conformation and modification on the formation of the complex. Peptides modelling the specific protein binding sites (i.e. the binding motif of the bZIP proteins), and also more simple peptides which may bind DNA only selectively will be synthesized. The interaction of these peptides with several series of synthetic DNA oligonucleotide duplexes of different sequence will be studied using physicochemical and molecular biology methods. The importance of DNA grooves in the DNA-peptide binding will be investigated using oligonucleotides containing noncanonical bases in the sequences of binding sites.

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

BO - Biofyzika

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Výsledky dosažené při řešení projektu významně přispívají k poznání pravidel, jimiž se řídí selektivní interakce DNA s proteiny. Odborný přínos projektu je nesporný. Nejvýznamnější výsledek byl získán s využitím peptidů odpovídajících DNA-vazebnému místu

Zahájení řešení

1. 1. 1996

Ukončení řešení

1. 1. 1998

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/1999/GA0/GA09GA/V/6:6

Datum dodání záznamu

—

Celkové uznané náklady

747 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

480 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč