Interakce nádorově supresorových proteinů s DNA. Úlohy konformace DNA a modifikací proteinu

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Interactions of tumor suppressor proteins with DNA. Roles of DNA conformation and protein modifications

Anotace anglicky

The ability of tumor suppressor protein p53 to bind to specific DNA sequences and to certain types of DNA conformational motifs are crucial for its function in regulating transcription as well as in its transcription-independent roles in DNA repair and recombination. Loss of the p53 DNA binding functions frequently results in cancer development. In this project, we propose to study interactions of p53 and other p53-related checkpoint proteins with DNA structures specific for supercoiled DNA (to which wild type p53 binds with a strong preference: Palecek et al., Oncogene 1997, 15, 2201-2209) such as open local structures or bents. Binding selectivity of the protein to these structures will be studied using wild type p53 as well as deletion mutants (involving the p53 DNA-binding core and C-terminal domains, and the oligomerization domain) and fusion constructs, and p53 homologues such as protein p73. We propose to study the roles of the individual protein domains and the effects of

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

FD - Onkologie a hematologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Výsledky řešení projektu přispěly k poznání interakcí proteinu p53 s DNA, především s ohledem na konformaci a topologický stav DNA a její poškození. Při selektivní interakci p53 s nadšroubovicovou DNA (SCS vazba) mimo specifické vazebná místa (p53CON) hr

Zahájení řešení

1. 1. 2002

Ukončení řešení

1. 1. 2004

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7

Datum dodání záznamu

2. 6. 2008

Celkové uznané náklady

4 448 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 042 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

1 406 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč