Strukturní aspekty interakcí proteinů kontrolních míst (checkpoint)s DNA

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Structural aspects of interactions of checkpoint proteins with DNA

Anotace anglicky

Cancer is now seen as a disturbance of the molecular information processing routines that ensure orderly cell growth in the healthy organism Several "checkpoint" proteins are involved in this process. One of the most prominent is p53 protein whose binding to DNA is closely related to its function. Recently we have shown that p53 binds preferentially to supercoiled (sc) DNA (1). In the first stage of this project we propose to elucidate the interactions of wild type human p53 with scDNA. To reach this goal we wish to locate the binding sites in scDNA and to terst the influence the en vironmental conditions such as effect of metal ions, oxidation agents, temperature, etc.on the conformation of the protein and its interactions both with sc DNAA andwith linear DNA fragments. In addition to the usual methods such as gel elektrophoresis, immunoblotting and electron mikroscopy we intend to employ also capillary elektrophoresis, scaning force mikroscopy and methods of elektrochemical analysis which hav

Kategorie VaV

—

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

FD - Onkologie a hematologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešení projektu přineslo nové poznatky o sekvenčně specifické vazbě proteinu p53 na DNA. Protože regulace schopnosti p53 vázat se na DNA může představovat jeden z možných mechanismů, kterými je ovlivňována aktivita tohoto proteinu in vivo, jedná se o atr

Zahájení řešení

1. 1. 1999

Ukončení řešení

1. 1. 2001

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2002/GA0/GA02GA/U/N/7:3

Datum dodání záznamu

1. 4. 2003

Celkové uznané náklady

4 366 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 238 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

3 688 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč