Automatická analýza mikroskopických snímků Langerhansových ostrůvků

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 18 (SGA0201400001)

Hlavní účastníci

České vysoké učení technické v Praze / Fakulta elektrotechnická<br>Institut klinické a experimentální medicíny

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

14-10440S

Název projektu anglicky

Automatic analysis of microscopy images of Langerhans islets

Anotace anglicky

Transplantation of isolated islets of Langerhans is an experimental treatment, which improves the patients’ quality of life and has the potential to cure diabetes. The proposed project responds to the need for an automatic method for rapid and accurate evaluation of the quantity and shape of the isolated islets, in order to assess the transplant viability. Various simple computerized methods based on digital image analysis are used to assist an operator. However, these approaches are tied to specific equipment thus preventing inter-laboratory standardization. Often, they are time consuming and inaccurate because of unsubstantiated assumptions of the islet shapes. We plan to develop new automatic self-tuning method trained on the ground truth established by four independent medical experts. The islet shape models will be based on 3D measurements of real islets by confocal microscopy. After validation, the novel algorithm will be available free of charge to the Langerhans islet community to enable the inter-laboratory comparison and to facilitate international clinical trials.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

JD - Využití počítačů, robotika a její aplikace

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

20204 - Robotics and automatic control<br>20205 - Automation and control systems

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byl vyvinut robustní segmentační algoritmus založený na klasifikátoru typu random forest, který umožňuje segmentovat snímky pořízené při různých světelných podmínkách a společně s algoritmem pro vyhodnocení čistoty odebraného vzorku byl implementován v Javovském pluginu IsletJ.

Zahájení řešení

1. 1. 2014

Ukončení řešení

23. 4. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

4. 5. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 6. 2019

Celkové uznané náklady

3 865 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 865 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč