Struktury pre-mRNA v regulaci genové exprese u kvasinek

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 18 (SGA0201400001)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

14-19002S

Název projektu anglicky

pre-mRNA structures in the regulation of gene expression in yeast

Anotace anglicky

Saccharomyces cerevisiae is a microorganism of key importance for biotechnology as well as for cell biology. We want to explore the role of introns in the regulation of gene expression with emphasis on ribosomal protein coding genes (RPGs). We found previously that splicing of introns with long distance between branch point (BP) and 3’ splice site (3’ss) requires an intramolecular RNA structure. RPGs exist mostly as pairs of highly conserved paralogs, which have divergent introns. We identified a number of cases where one of the paralogs has intron with long BP to 3’ss distance. Recent genome wide studies documented the existence of inter-genic regulatory circuitries controlling the relative concentrations of proteins coded by RPG paralogs. We want to uncover the roles the intronic sequences and structures play in RPGs inter-genic regulations. We will examine their communications with ribosomal proteins and effector complexes of RNA metabolism. We also aim to determine the significance of intronic structures for the yeast’s response to stress and fitness.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

EI - Biotechnologie a bionika

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30101 - Human genetics<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt přinesl nové poznatky týkající se regulačních mechanizmů produkce ribosomálních proteinů v kvasinkách založených na sestřihu pre-mRNA. Postup prací byl v souladu s plněním cílů a grantovými pravidly. Výsledky byly publikovány ve 2 článcích v impaktovaných časopisech.

Zahájení řešení

1. 1. 2014

Ukončení řešení

23. 4. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

17. 3. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 6. 2019

Celkové uznané náklady

7 040 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 040 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč