Charakterizace regulačních mechanizmů sestřihu mRNA ve skrytých donorových místech sestřihu

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Mezinárodní grantové projekty hodnocené na principu LEAD Agency

Veřejná soutěž

—

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Lékařská fakulta

Druh soutěže

M2 - Mezinárodní spolupráce

Číslo smlouvy

24-11219K

Název projektu anglicky

Characterising the regulatory mechanisms at decoy 5’ splice sites

Anotace anglicky

In the last few years, it has been shown that cryptic splice sites can play an important role in regulating RNA splicing and thus gene expression. Many such cryptic regulatory sites remain to be discovered, and their mechanisms of action examined. Here we will focus on decoy 5’ splice sites (d-5’ss), which contain consensus sequences of 5’ splice sites and assemble some spliceosomal components. We will assess two hypothetical modes of their action. First, we will attempt to determine the proportion of d-5’ss that assemble non-productive spliceosomal complexes, which compete with recognition of nearby canonical splice sites. Second, we will determine the proportion of d-5’ss that are cleaved via a splicing reaction, but the resulting transcripts are then targeted for degradation. Finally, we will study representative examples of both types of d-5’ss to assess their mechanisms in more detail, and examine their impact on the expression and localisation of the transcripts produced from their host genes at various stages during neuronal differentiation.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EB - Genetika a molekulární biologie

Zahájení řešení

1. 4. 2024

Ukončení řešení

31. 12. 2027

Poslední stav řešení

Z - Začínající víceletý projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-GA0-GF-R

Datum dodání záznamu

29. 3. 2024

Celkové uznané náklady

8 364 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

8 329 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

35 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč