Prognostický a prediktivní význam alternativních sestřihových variant genu BRCA1 u karcinomu prsu

Poskytovatel

Ministerstvo zdravotnictví

Program

Resortní program výzkumu a vývoje Ministerstva zdravotnictví III

Veřejná soutěž

VaV pro Ministerstvo zdravotnictví III 2 (SMZ0201101)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

NT12280-4/2011

Název projektu anglicky

BRCA1 alternative splicing variants and their prognostic and predictive role in breast cancer

Anotace anglicky

The aim of the project is identification of BRCA1 splicing variants specificity regarding their significance as a prognostic factors and predictive markers of breast cancer. cDNA will be synthesized from RNA isolated from mammary tissue samples receivedfrom breast cancer patients and from women without breast cancer and from their peripheral blood. BRCA1 mRNA splicing variants will be identified using cDNA as a template for PCR amplification with primers localized in 5´ and 3´ BRCA1 UTR and subsequently analyzed by fragmentation gel electrophoresis (Agilent 2100). Detected BRCA1 splicing variants will be cloned into TA ? cloning vector and sequenced. Tissue specific expression of particular variants will be quantified by qPCR. Differences between splicing patterns of lymphocytes and mammary tissue within patients with breast cancer and controls will be statistically evaluated. BRCA1 splicing variants within breast cancer patients will be evaluated in relation to disease course and treatment.

Kategorie VaV

NV - Neprůmyslový výzkum (aplikovaný výzkum s výjimkou průmyslového)

CEP - hlavní obor

FD - Onkologie a hematologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Byl vyvinut nový přístup pro identifikaci nestřihových variant BRCA1mRNA. Bylo identifikováno 36 alternativních nestřihoivých variant ve vzorcích 228 žen. Jedná se o prioritní analýzu exprese alternativních nestřihových variant.

Zahájení řešení

1. 6. 2011

Ukončení řešení

31. 12. 2014

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

21. 3. 2014

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP15-MZ0-NT-U/05:3

Datum dodání záznamu

14. 12. 2015

Celkové uznané náklady

5 159 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

5 159 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč