Rekombinační schopnost virů k prolomení druhové bariéry a obranných mechanismů hostitele: myší cytomegalovirus v hybridní zóně myší domácích.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 18 (SGA0201400001)

Hlavní účastníci

Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

14-35009S

Název projektu anglicky

Quantifying viral gene capture, and the host’s response, during passage across a species barrier: Murine cytomegalovirus in a house mouse hybrid zone.

Anotace anglicky

The fastest way to produce genetic novelty in a Red Queen host-parasite arms race may be the rapid production of new sequence or gene combinations by recombination. In a hybrid zone recombination across taxa can make production of novel (re)combinations even richer, and their detection (due to previous divergence) easier. We propose the house mouse hybrid zone (HMHZ) and the murine cytomegalovirus (MCMV) as an ideal system to study such dynamics and test the predictions of the recently published Red Queen Recombination model. The HMHZ is the best understood secondary contact species barrier in nature; MCMV is the laboratory mouse model for its human equivalent, and so MCMV ecology and molecular biology are well described; its genome of ~170 genes is easy to study and sequence in its entirety (at ~230 kb). Combined with Next Generation tools available for the mouse host, the HMHZ/MCMV study system will allow us to quantify the ability of a virus to capture genes enabling it to cross a species barrier, and of its host to respond by incorporating alternative defence variants.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EH - Ekologie – společenstva

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Výzkum byl realizován v souladu s plány, které byly vytyčeny v rámci tříletého projektu. Úspěšně byly splněny první dva cíle, částečně byl splněn cíl třetí. Toto zdržení neovlivnilo celkový úspěch projektu, jelikož jak genomická, tak genetická data byla získána a momentálně je dokončována jejich analýza. Dvě IF publikace byly publikovány. V rámci projektu byl také školen jeden PhD student.

Zahájení řešení

1. 1. 2014

Ukončení řešení

23. 4. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

17. 3. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 6. 2019

Celkové uznané náklady

6 095 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 095 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč