Hybridní zóny: přírodní laboratoře pro studium patogenů vzniku

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

Hlavní účastníci

Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-20049S

Název projektu anglicky

Hybrid zones: natural laboratories for the study of pathogen emergence

Anotace anglicky

Recombination and adaptation to a new host are keys factors of pathogen emergence. While studying host-parasite interactions in the European house mouse hybrid zone, we recently demonstrated parasites with an intimate host relationship have genetic structure mirroring the host zone and produce hybrid parasites at its centre. We have also evidence, for a DNA virus, that genes which subvert the mouse host immune system introgress preferentially. The first goal of this project is a comparative genomic approach to test the universality of this pattern of preferential introgression using two additional parasite models belonging to two other kingdoms, a yeast-like fungus Pneumocystis murina and a nematode Syphacia obvelata. The second goal is to test the adaptive nature of implicated genes via a common garden experiment. By incorporating the use of state-of-the-art sequencing, analytical and computational methods this project will elucidate major processes in parasite recombination and evolution fundamental to the field of emerging diseases.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

40301 - Veterinary science

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Hodnota uváděných publikačních výstupů je snížena mnohonásobnými dedikacemi na další řešené GAČR projekty na pracovišti řešitelky. Nejvýznamnějším výstupem by měla být připravovaná publikace Petružela et al., „Comparative genomics of parasites in the European house mouse hybrid zone“.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

11. 12. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

16. 4. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 4. 2021

Celkové uznané náklady

8 881 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

8 881 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč