Srovnávací genomika hybridizace parazitů s ohledem na míru divergence hostitelů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 22 (SGA0201800001)

Hlavní účastníci

Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

18-19629S

Název projektu anglicky

Comparative parasite hybridisation genomics controlling for host divergence

Anotace anglicky

Parasite hybrid zones are understudied despite being natural laboratories for examining the mechanisms underlying host-parasite adaptation and specificity. A host natural system with pairwise contacts between taxa of different divergence times allows patterns of parasite genome introgression to be related to host divergence time. We propose to investigate the population genomic introgression patterns of the betaherpesviruses and the nematode Syphacia, parasites of the multimammate mouse, Mastomys natalensis, in Tanzania where 3 intraspecific taxa of the host meet and hybridize. We hypothesise that for both host and parasite barriers to introgression will increase with host pair divergence time, contacts between more closely related host taxa having wider clines in allele frequencies than contacts between more divergent taxa. This pattern should be even more pronounced for their parasites given their shorter generation time. Comparison of host/parasite genome-wide introgression patterns may, further, allow us to identify genes key to host-parasite interaction (e.g. “emergence” genes).

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EA - Morfologické obory a cytologie

Zahájení řešení

1. 1. 2018

Ukončení řešení

31. 12. 2023

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

25. 3. 2020

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP22-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

22. 2. 2022

Celkové uznané náklady

9 472 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 117 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

355 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč