Fylogenetické vymezení rodů sinic pomocí multilokusové analýzy typových druhů

Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 19 (SGA0201500001)
Hlavní účastníci
Botanický ústav AV ČR, v. v. i.<br>Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
15-11912S

Název projektu anglicky
Phylogenetic establishment of cyanobacterial genera through multilocus of the generitypes
Anotace anglicky
The proposed project will provide a modern taxonomic framework for cyanobacteria based on multilocus phylogenetic analysis of the type or well-established species in classical and recently described cyanobacterial genera. Generitypes for European genera will be collected from type localities or from typical habitats near the type localities. We will simultaneously attempt isolation of strains and conduct whole genome amplification (WGA). PCR of 16S rRNA, 16S-23S ITS region, 23S rRNA, rpoC1, rbcLX, and rpoB will be conducted either from isolates or the stored WGA. For isolates which represent unknown clades we will generate draft genome sequences that will be made either using the WGA product or genomic DNA from the strains. We will also make use of an extensive set of isolates we have made from regions around the world to obtain these loci for recently described genera, and take advantage of the growing number of sequenced genomes that are becoming available to augment our taxon sampling. This will enable genome-scale phylogenetic analysis of most cyanobacterial genera.

Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EF - Botanika
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology

Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Cílem projektu bylo revidovat taxonomické uspořádání sinic a jejich fylogenetické vztahy. Závěrečná zpráva je sepsána přehledně, řešení projektu probíhalo podle plánu, hlavní vytčené cíle byly splněny a výsledky projektu byly publikovány formou 14 impaktovaných publikací, z nichž však u dvou chyběla dedikace. Dalších pět publikací je v tisku. Projekt byl proto splněn.

Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP18-GA0-GA-U/02:1
Datum dodání záznamu
4. 5. 2018

Podobné projekty(10)