Endosymbionti příbuzní kinetoplastidů v amébách rodu Neoparamoeba Page, 1987
Cíle projektu
Projekt je zaměřen na objasnění fylogeneze eukaryotického organismu příbuzného kinetoplastidům, který žije v symbiose samébami rodu Neoparamoeba Page, 1987. Překvapující blízká fylogenetická příbuznost tohoto organismu s bičíkovcem Ichthyobodo necator, kosmopolitně rozšířeným ektoparazitem ryb, byla odvozena na základě fylogenetické analýzy souboru dat, v němž byla pouze jedna sekvence SSU rRNA genu symbiotického organismu a jedna sekvence I. necator. V současné době již existuje velký soubor sekvencí geneticky i biologicky odlišných kmenů I. necator, a podařilo se nám postupně získat bohatý soubor kmenů rodu Neoparamoeba. Na základě poznání subbuněčné organizace a získáním sekvencí SL RNA a SSU rRNA genů chceme u co největšího souboru symbiontů (z améb různého hostitelského a geografického původu) ověřit hypotézu jejich heterogenity, porovnat je s různými genotypy bičíkovce I. necator a získat nové poznatky o původu symbiontů a jejich koevoluci s hostitelskými amébami.
Klíčová slova
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 8 (SGA02005GA-ST)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
206/05/2384
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Kinetoplastic endosymbionts in amoebae of the genus Neoparamoeba Page, 1987
Anotace anglicky
The aim of the submitted proposal is to elucidate phylogeny of the eukaryotic organism living as endosymbiont in amoebae of the genus Neoparamoeba Page, 1987. The project is based on our previous finding that the symbiont is dosely related to the kínetoplastid flagellate Ichthyobodo necator, a cosmopolitan ectoparasite of fish. This resulted from phylogenetíc analyses of dataset that contained one SSU rRNA gene sequence of the symbiont and one of I. necator currently available. Recently, sequences of genetícally and biologically different strains of I. necator have been obtained. In addition, we have collected an extensive assemblage of Neoparamoeba strains of different host- and geographic origin. Using methods of light and electron microscopy and molecular analyses of sequences of SL RNA and SSU rRNA genes, we propose to discover the supposed heterogeneity of the symbionts living in various strains of Neoparamoeba spp. Consequently, along with confrontation of these fíndings with
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EA - Morfologické obory a cytologie
CEP - vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10601 - Cell biology
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Výzkum endosymbiontů mořských améb rodu Neoparamoeba Page, 1987 zaměřený na symbionty příbuzné kinetoplastidům byl úzce vázán na souběžný výzkum hostitelských améb - potenciálních původců amébového onemocnění žaber ryb. Časově náročnými izolačními pokusy
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2005
Ukončení řešení
31. 12. 2007
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
2. 5. 2007
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP08-GA0-GA-U/04:3
Datum dodání záznamu
16. 12. 2008
Finance
Celkové uznané náklady
2 196 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
2 196 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
2 196 tis. Kč
Statní podpora
2 196 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EA - Morfologické obory a cytologie
Doba řešení
01. 01. 2005 - 31. 12. 2007