Introgrese přes druhovou bariéru a její analýza ve vysokém rozlišení

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 19 (SGA0201500001)

Hlavní účastníci

Ústav biologie obratlovců AV ČR, v. v. i.<br>Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

15-13265S

Název projektu anglicky

High resolution genomic analysis of introgression across a species barrier

Anotace anglicky

The project goal is to infer the role of intragenomic conflict in the origin and/or breakdown of species barriers. Genetic traces of admixture between modern humans and Neanderthals have provoked strong interest in fine scale patterns of introgression within genomes. Recently we have constructed a survey of precisely these fine scale patterns in the only mammalian admixture system with equivalent genome resolution: the European House mouse hybrid zone (HMHZ). Our high resolution analysis allows ancestral and introgression polymorphism to be clearly distinguished – a fundamental problem in understanding the history of species. This project capitalises on this unique genomic resource. We will use our extensive sample databank and prior understanding of the HMHZ supplemented by targeted sampling of new material. The history and action of candidate genes will be verified using focal genetic surveys (hybrid enrichment technology), combined with lab crosses and phylogeographic analyses of house mouse colonisation history.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EG - Zoologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt se stal dalším kouskem do skládačky našich znalostí o hybridní zóně dvou domácích myší, tentokrát řešící kromě introgrese genů také specificitu parazitů a tvar jejich vlastní hybridní zóny. Výsledky mají širší význam pro evoluční biologii. Výstupy odpovídají cílům projektu a jsou publikované v časopisech s velkým dopadem. Drobné změny v čerpání financí jsou rozumně zdůvodněné.

Zahájení řešení

1. 1. 2015

Ukončení řešení

29. 11. 2019

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

17. 3. 2017

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP20-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

2. 7. 2020

Celkové uznané náklady

9 999 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 999 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč