Genetická kontrola celogenomové meiotické rekombinace a rozpoznání homologů
Cíle projektu
S využitím "forward genetics" přístupu budeme zkoumat vztah meiotické rekombinace a genové konverze k synapsi homologních chromozomů na modelu vnitro- a mezi-poddruhových konsomických kmenů myší. Sledovanými fenotypy budou rekombinační noduly mismatch repair proteinu MLH1, SNP v oblastech genové konverze, nebo osy asynaptických chromozomů označené HORMAD2 proteinem. Divergence dvou myších poddruhů nám poprvé umožní mapovat místa v genomu odpovědná za rozpoznání a synapsi homologů v pachytenním stadiu meiozy. Pozičním klonováním identifikujeme sex-specifický a X-vázaný gen, který modifikuje celogenomovou frekvenci genetické rekombinace, a objasníme jeho vztah k meiotické synapsi. Pro sledování vlivu sekvenční divergence na genovou konverzi budeme srovnávat oblasti genových konverzí a jejich lokalizací v genomech mezi- a vnitro-druhových konsomických myší. Získané poznatky přispějí k lepšímu pochopení základních mechanizmů savčí meiozy a jejich úlohy v gametogenezi.
Klíčová slova
Global crossover rategene conversionhomolog synapsisSYCP1SYCP3HORMAD2
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 20 (SGA0201600001)
Hlavní účastníci
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
16-01969S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Genetic Control of Genome-Wide Meiotic Recombination Rate and Homolog Recognition
Anotace anglicky
We will employ a forward genetic approach to investigate the role of meiotic recombination and gene-conversion in synapsis of homologous chromosomes using inter- and intra-subspecific consomic mouse strains as a model. The studied phenotypes include recombination nodules with mismatch repair protein MLH1, SNPs within the gene-conversion tracts, or HORMAD2-decorated axis of asynapsed chromosomes. The divergence between two mouse subspecies will allow us, for the first time, to map the genomic sites responsible for recognition and synapsis of homologs at the pachytene stage of meiosis. We will employ positional cloning to identify the sex-specific and X-linked modifier of global genetic recombination rate and to elucidate its role in meiotic synapsis. To study the effect of sequence heterology on gene conversion tracks we will compare their areas and localizations in the genomes of two inter-subspecific and two intra-subspecific consomic strains. The obtained findings will contribute to better understanding of the basic mechanisms of mammalian meiosis and their role in gametogenesis.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Grantový projekt evaluující roli Prdm9 pro oblast Hstx2 na X chromozómu ve vztahu k hybridní sterilitě, frekvenci rekombinace a chromozomální synapsi. Výsledky jsou publikovány v prestižních časopisech. Celkově je prezentováno 6 vynikajících článků, z nichž však jen 3 mají dedikaci k projektu.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2016
Ukončení řešení
29. 11. 2019
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
24. 5. 2018
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP20-GA0-GA-U/01:1
Datum dodání záznamu
2. 7. 2020
Finance
Celkové uznané náklady
6 349 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
5 827 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
522 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
6 349 tis. Kč
Statní podpora
5 827 tis. Kč
91%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EB - Genetika a molekulární biologie
Doba řešení
01. 01. 2016 - 29. 11. 2019