Kontrola umístění dvouřetězcových zlomů DNA v meióze laboratorního potkana

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

Hlavní účastníci

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-06548S

Název projektu anglicky

Control of hotspots of meiotic double-strand DNA breaks in Rattus norvegicus

Anotace anglicky

The sites of meiotic double strand breaks and thus the sites of genetic recombination are determined by the PRDM9 (PR/SET-domain carrying 9) protein, an epigenetic factor that carries histone-3-lysine-4 (H3K4) methyltransferase activity. This protein is essential for fertility in the laboratory mouse but not in the dog. Some yet not all mice heterozygous for certain Prdm9 mutations display sex-specific sterility, but it is unknown if the difference in fertility is caused by the variation in Prdm9 mutations or in genetic background. Sterile human patients with heterozygous PRDM9 mutations were identified; however, these mutations have not been confirmed as causative. We produced four Prdm9 mutants harboring deletions in one of the exons encoding the catalytic PR/SET domain of the spontaneously hypertensive rat and thus obtained a unique opportunity to analyze the precise genomic distribution of recombination sites as well as fertility of the heterozygous and homozygous animals. Moreover, these analyses will allow us to control rat genetic recombination.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt charakterizoval distribuci míst meiotických zlomů DNA a rekombinace a její vztah k fertilitě u laboratorního potkana. Získané výsledky podpořily hypotézy o vlivu proteinu Prdm9 na fertilitu prostřednictvím relokace rekombinačních míst a na asociaci pohlaví a fertility.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

11. 12. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

24. 5. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GA-U/06:1

Datum dodání záznamu

30. 6. 2021

Celkové uznané náklady

8 727 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

8 274 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

453 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč