Úloha PRDM9 zprostředkované synapse meiotických chromozomů v hybridní sterilitě
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202000001
Hlavní účastníci
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
20-04075S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
The role of PRDM9-mediated synapsis of meiotic chromosomes in hybrid sterility
Anotace anglicky
By using laboratory strains of mice as a model we identified Prdm9 as the first hybrid sterility gene in vertebrates. Although this model of hybrid sterility has proved robust and reproducible, its function as a reproductive isolation barrier in natural populations remains unknown. Thus, in this project we will ascertain the role of Prdm9 in meiotic recombination, chromosome pairing, and fertility of hybrids between wild mice with sequenced ZnF domains of Prdm9 and genetically modified laboratory mice. Impaired synapsis of homologous chromosomes in meiosis of sterile males has been explained by asymmetric erosion of PRDM9 DNA binding sites. As generalization of the hypothesis we posit the anti-recombination effect of mismatch repair genes in the mechanism of chromosomal asynapsis and hybrid sterility. The idea will be examined in hybrids with deletion of Msh2 and Msh6 MMR genes. Upon positional cloning of the Hstx2 locus known to interact with the Prdm9 gene, we will study its structure by genomic optical mapping and the effect of Hstx2 at the mRNA and miRNA levels by RNA-seq.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EB - Genetika a molekulární biologie
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt byl zaměřen na objasnění úlohy genu Prdm9 v reprodukční izolaci mezi přírodními populacemi hybridních myší. Významným výsledkem je objasnění molekulárního mechanizmu hybridní sterility řízené Prdm9, popis jeho genových a chromozomálních komponent a potvrzení nezávislosti na genetickém pozadí. Výsledky jsou publikovány ve 4 článcích v recenzovaných (2 ve špičkových) časopisech s IF.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2020
Ukončení řešení
31. 12. 2022
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
12. 4. 2022
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP23-GA0-GA-U
Datum dodání záznamu
26. 6. 2023
Finance
Celkové uznané náklady
10 811 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
10 568 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
243 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč