Strukturní a funkční analýza systémů pro translokaci K+ u kvasinek kódovaných pomocí genů TRK1 a TRK2.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

Hlavní účastníci

Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-19221S

Název projektu anglicky

Structural and functional analysis of the yeast K+ translocation system(s) encoded by TRK1 and TRK2 genes

Anotace anglicky

In yeast TRK1 and TRK2 genes encode K+ uptake system(s) that allow cells to grow in media containing only a few µM K+. Trk1 and Trk2 belong to the SKT family of ion translocation systems that have evolved from a precursor of prokaryotic K-channels. Most SKT proteins have acquired cytoplasmic regulatory domains encoded by a another gene, while Trk1,2 possess a “long hydrophilic loop” (LHL) inserted in the peptide chain within the transmembrane domain. Although, the sequence of Trk1,2 proteins is known since 1991, the structure is not yet available. Except of their main role, K+ transport, Trks are able to translocate Cl-.which most probably requires multimerization of several Trk1,2 proteins. The proposal is based on our previous work, in which we developed a refined model of the transmembrane part of Trk1. It is designed as a combined experimental and theoretical (molecular modeling) approach to study the multimerization state of Trk1,2 proteins including possible heteromer formation, the role of multimerization in K+ or Cl- translocation and to define the role of LHL.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

BO - Biofyzika

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10610 - Biophysics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Autoři tohoto projektu charakterizovali kationtový přenašečový systém Trk1 a Trk2, a prokázali, že Trk1 je funkční I bez dlouhé hydrofilní smyčky. Jejich výsledky ukázaly, že tato smyčka moduluje transportní vlastnosti TrK1 cestou působení na transmembránové helixy, kterým přímo modifikuje velikost poru a selektivní filtr. Výsledke je publikace v BBA-Biomembranes.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

11. 12. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

24. 5. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 4. 2021

Celkové uznané náklady

3 676 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 676 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč