Strukturní a funkční determinanty na kanálech TRPM5 a TRPM8
Veřejná podpora
Poskytovatel
Akademie věd České republiky
Program
Granty výrazně badatelského charakteru zaměřené na oblast výzkumu rozvíjeného v současné době zejména v AV ČR
Veřejná soutěž
Výzkumné granty 7 (SAV02007-A)
Hlavní účastníci
—
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
IAA600110701
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Structural and functional determinants on TRPM5 and TRPM8 channels
Anotace anglicky
The main aims of this proposal are to characterize the secondary structures of N- and C-intracellular termini of channels TRPM5 and TRPM8. Another part of the project will be the localization of the binding site(s) for calmodulin on both termini of TRPM5and TRPM8 The series of different lengths of fusion proteins of both termini of both channels will be made to obtain sufficient amounts of soluble proteins. Another goal will be to localize the selectivity filter in the loop between TM5 and TM6 in TRPM5and TRPM8, respectively. The role of the aminoacids residues in the lower part of alpha helix of TM6 in gating processes of TRPM5 and TRPM8 will be also followed. To confirm experimentally acquired data on native TRPM5, and TRPM8 and their mutant constructs the homology model of TRP channels will be created by dynamic molecular simulation based on KcsA bacterial channel template / or mammalian potassium Shaker channel.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
ED - Fyziologie
CEP - vedlejší obor
CE - Biochemie
CEP - další vedlejší obor
BO - Biofyzika
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics<br>30105 - Physiology (including cytology)
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Byly identifikovány vazebné motivy pro ATP a kalmodulin na C-konci TRPV1 Podobně byla charakterizována vazebná místa pro kalmodulin na C-koncích TRPC6, TRPV2 a TRPV5. Byly určeny transmembránové domény zodpovědné za otvírání a zavírání TRPA1 kanálu.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2007
Ukončení řešení
31. 12. 2011
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
18. 3. 2011
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP12-AV0-IA-U/02:2
Datum dodání záznamu
28. 6. 2013
Finance
Celkové uznané náklady
3 072 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
3 072 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč