Studium strukturních a vazebných vlastností TRPM kanálů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 21 (SGA0201700001)

Hlavní účastníci

Fyziologický ústav AV ČR, v. v. i.<br>Univerzita Karlova / Matematicko-fyzikální fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

17-04236S

Název projektu anglicky

Study of structural and binding properties of TRPM channels

Anotace anglicky

TRP channels are cellular sensors for a wide spectrum of physical and chemical stimuli. Phosphatidylinositol–4,5-bisphosphate (PIP2) is a intracellular messenger which directly interacts with many different effector proteins. The enormous diversity of PIP2 effector proteins allow PIP2 signaling to control a broad range of cellular functions. TRP channels gating processes are regulated by PIP2 binding. The aims of this project will be identification binding sites for PIP2 in both intracellular N- and C-termini of TRPM channels. Fusion proteins of different lengths and mutations in N- and C-termini will be prepared and use for binding experiments with PIP2 employing spectroscopy methods. The data will be correlated with results from electrophysiology experiments. TRPM channels and their appropriate mutated constructs in putative PIP2 binding sites will be expressed in HEK 293 cells. Homology models of TRPM channels based on known structures of TRPV1, TRPV2 and TRPA1 channels will be studied by means of molecular dynamics simulations for their interactions with PIP2.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

FH - Neurologie, neurochirurgie, neurovědy

CEP - vedlejší obor

CE - Biochemie

CEP - další vedlejší obor

ED - Fyziologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30103 - Neurosciences (including psychophysiology)<br>30105 - Physiology (including cytology)<br>30210 - Clinical neurology

Hodnocení poskytovatelem

O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena

Zhodnocení výsledků projektu

Předmětem bylo studium aktivace TRPM kanálů signály kalmodulin/S100A1/PIP. Byla specifikována řada nových vazebných míst pro TRPM kanály, bylo možno přispět k objasnění mechanismu vazby ligandů do vazebného rozhraní TRPM kanálů a jejich vlastností. Projekt byl předčasně ukončen ze strany příjemce, všech stanovených cílů řešení nemohlo být dosaženo, projekt je tedy hodnocen jako nesplněný.

Zahájení řešení

1. 1. 2017

Ukončení řešení

31. 12. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

11. 6. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-GA0-GA-U/01:2

Datum dodání záznamu

2. 3. 2020

Celkové uznané náklady

4 246 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 747 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

499 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč