Strukturní podstata vzniku nových enzymových aktivit

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-24223S

Název projektu anglicky

Structural basis for the emergence of new enzymatic activities

Anotace anglicky

Understanding of the emergence of new enzymatic function at the molecular level is among the key questions in biology. The main objective of this project is to provide structural insights into catalysis of resurrected ancestor of two functionally distinct enzymes, eukaryotic haloalkane dehalogenase from Strongylocentrotus purpuratus and luciferase from Renilla reniformis, exhibiting promiscuous hydrolase and oxidoreductase activity. We also want to understand why the modern-day enzymes exhibit distinct activities, although they are closely evolutionary and structurally related. This objective will be achieved by X-ray crystallographic analysis of the ancestor and its complexes with selected ligands combined with molecular modeling, site-directed mutagenesis, steady-state and pre-steady-state kinetics. Through analysis of the structure-function relationships will be possible to elucidate catalytic mechanism of resurrected ancestor and explain distinct functionality of modern enzymes. Acquired knowledge will pave the way towards designing enzymes with novel catalytic activities.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CE - Biochemie

CEP - vedlejší obor

BO - Biofyzika

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V rámci projektu byla provedena detailní funkční a strukturní charakterizace luciferasy AncHLD-RLuc a srovnání s příbuznými enzymy LinB a RLuc8. Byla vyřešena krystalová struktura AncHLD-RLuc, byl objasněn katalytický mechanismus tohoto enzymu a byly identifikovány oblasti umožňující výrazné zvýšení katalytické účinnosti. V rámci projekty byly publikovány tři články a jeden je v recenzním řízení.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

31. 12. 2018

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

25. 5. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP19-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 6. 2019

Celkové uznané náklady

6 800 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

6 672 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

128 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč