Komplexní cytogenetická a mutační analýza psích mastocytomů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 20 (SGA0201600001)

Hlavní účastníci

Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

16-26655S

Název projektu anglicky

Comprehensive cytogenetic and mutational analysis of canine mast cell tumours

Anotace anglicky

Mast cell tumours (MCTs) are common skin neoplasias in dogs. The aetiology of the disease is still unknown and the prognosis is difficult to assess. The aim of the project is to perform a comprehensive analysis of MCTs combining a cytogenetic and molecular genetic approach. Canine whole chromosome painting probes will be prepared for cytogenetic analysis of MCTs using fluorescence in situ hybridization. Recurrent clonal chromosome abnormalities will be analysed using canine BAC probes to localize the breakpoint regions and, in the case of significant association with a specific clinical outcome, to propose a diagnostic and prognostic screening strategy. Mutational analysis of whole canine MCT exome will be performed using next-generation sequencing. Associations between the status of the genes mutated in MTCs, results of the cytogenetic analysis, histological grade and clinical outcome will be analysed to elucidate the genetic basis of MCTs and to propose relevant diagnostic and prognostic markers and potential therapeutic targets.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40301 - Veterinary science

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Hlavní cíle projektu byly splněny. Byly potvrzeny mutace v protoonkogenu c-kit, který je znám svým vztahem k mastocytomům, u významného % nádorů, kde byl také potvrzen jako negativní prognostický znak. Mezi dalšími objevenými mutacemi zaslouží pozornost pro další analýzu gen GNB1.

Zahájení řešení

1. 1. 2016

Ukončení řešení

22. 7. 2020

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

16. 4. 2018

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GA-U/01:1

Datum dodání záznamu

12. 4. 2021

Celkové uznané náklady

7 930 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 645 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

258 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč