Cizorodá DNA u ječmenů (Hordeum spp.) – jaké mechanismy na genomické úrovni podporují horizontální přenos genů u trav?
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Hlavní účastníci
Botanický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
17-06548S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Foreign DNA in barley (Hordeum spp.) – are there any genomic enablers of horizontal gene transfer in grasses?
Anotace anglicky
The evolutionary importance of horizontal gene transfer is increasingly acknowledged. In the genus Hordeum (Triticeae, Pooideae), we revealed a spectacular diversity of foreign rDNA (ribotypes) corresponding to panicoid grasses. They were likely acquired through several independent horizontal transfers. We found that foreign rDNA together with LTR-retrotransposons was transferred from Panicum to H. bogdanii. Within the proposed project, we will investigate the nature and dynamics of foreign genetic material in Hordeum with a focus on multiple foreign rDNA. H. stenostachys, possessing five different foreign ribotypes in its genome, will serve as a model species. A BAC library of H. stenostachys will be constructed for targeted identification and characterization of foreign DNA. Identified BAC clones will be used for a comparative study of other barley species. The investigation of H. stenostachys and related Hordeum species using molecular, bioinformatic and cytogenetic approaches will allow us to unlock the nature and evolutionary consequences of multiple integration of foreign DNA.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EF - Botanika
CEP - vedlejší obor
—
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2017
Ukončení řešení
31. 12. 2021
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
26. 4. 2019
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP21-GA0-GA-R/13:1
Datum dodání záznamu
22. 2. 2021
Finance
Celkové uznané náklady
8 184 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
6 807 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
1 377 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč