Charakterizace kompletní panikoidní DNA u divokých ječmenů jakožto významný krok k vymezení cizorodé složky v genomu ječmene
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202200004
Hlavní účastníci
Botanický ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
22-02469S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Ultimate screening of wild barley genomes for panicoid DNA: a further step towards delimiting the foreign-ome in Hordeum
Anotace anglicky
The pangenome is a set of all genes present in a given taxon. Besides core genes, a variable part of genes may be acquired from other taxa via horizontal gene transfer (HGT), potentially providing the recipient with an evolutionary benefit. The extent of acquisitions of foreign DNA, their stability and transmission to future generations, and the evolutionary consequences of HGT are almost unknown in plants. Hordeum (Pooideae) is a suitable model to investigate these processes. Species of sect. Stenostachys obtained foreign DNA, including protein-coding genes, from diverse panicoid grasses (Panicoideae) via at least nine independent HGTs. The aim of the project is to reveal the extent and nature of foreign DNA derived from panicoid grasses in Hordeum using whole-genome sequencing and subsequent bioinformatic and cytogenetic analyses. The characterization of panicoid DNA in Hordeum will help to elucidate the mechanisms of horizontal transfer, the evolution and dynamics of foreign DNA in host genomes, and the role of foreign protein-coding genes in the evolution of sect. Stenostachys.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
OECD FORD - vedlejší obor
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
OECD FORD - další vedlejší obor
10611 - Plant sciences, botany
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
EA - Morfologické obory a cytologie<br>EB - Genetika a molekulární biologie<br>EF - Botanika
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2022
Ukončení řešení
31. 12. 2024
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
29. 2. 2024
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP25-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
12. 3. 2025
Finance
Celkové uznané náklady
10 392 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
10 392 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč