Konstrukce modelu regulační sítě řízené sigma faktory RNA polymerasy v Corynebacterium glutamicum

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 21 (SGA0201700001)

Hlavní účastníci

Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

17-06991S

Název projektu anglicky

Construction of a model of regulatory network controlled by sigma factors of RNA polymerase in Corynebacterium glutamicum

Anotace anglicky

Bacterial RNA polymerase holoenzyme consists of a core enzyme and a dissociable sigma subunit that is responsible for recognition of specific promoter sequences. Corynebacterium glutamicum genome encodes the primary sigma factor SigA and 6 alternative sigma factors, which are involved mainly in transcription of stress response genes. The project is focused on elucidating the roles of sigma factors in expression of C. glutamicum genes, designing the structure and studying functions of sigma factor regulatory network. To analyze regulons controlled by particular sigma factors (sigmulons), both genome-scale techniques and single gene and promoter analyses will be used. To achieve complex results, in vivo, in vitro and in silico methods will be combined. The main tasks of the project are to discover distinct and overlapping regulons controlled by specific sigma factors, assign sigma factors to particular promoters and define the consensus sequences of the promoters of different classes. All gained results will be integrated in a model of sigma factor regulatory network in C. glutamicum.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Zahájení řešení

1. 1. 2017

Ukončení řešení

31. 12. 2021

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

10. 4. 2019

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GA-R/13:1

Datum dodání záznamu

22. 2. 2021

Celkové uznané náklady

5 013 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 932 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

81 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč