Mechanismy regulace transkripce řízené sigma faktory v Corynebacterium glutamicum

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Mezinárodní projekty

Veřejná soutěž

Mezinárodní projekty 3 (SGA02009GA1GC)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

204/09/J015

Název projektu anglicky

Transcriptional regulatory network(s) controlled by sigma factors in Corynebacterium glutamicum

Anotace anglicky

Bacterial sigma factors reversibly bind to the multisubunit core RNA polymerase to constitute a holoenzyme and control the specific transcription initiation from various classes of promoters. The primary sigma factor recognizes the promoters of housekeeping genes whereas alternative sigma factors are involved in growth-dependent transcription and in cell response to exogenous factors, such as heat, osmotic and oxidative stress. The bilateral project is focused on elucidating the roles of the alternativesigma factors in function of individual promoters and in the complex regulatory network controlling gene expression in Corynebacterium glutamicum. The methods of promoter analysis will be combined with global genome analysis used in the German laboratory. Identification of the promoters recognized by alternative sigma factors, assigning the individual promoters to the particular sigma factors, definition of the consensus sequences of the promoter classes and use of the characterized promoters for the construction of controlled expression systems are the main aimes of the Czech team.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EE - Mikrobiologie, virologie

CEP - další vedlejší obor

EI - Biotechnologie a bionika

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30101 - Human genetics<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešení projektu proběhlo podle plánu jak z hlediska odborného tak i z hlediska čerpání finančních prostředků.

Zahájení řešení

1. 1. 2009

Ukončení řešení

31. 12. 2011

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

16. 4. 2011

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP12-GA0-GC-U/01:1

Datum dodání záznamu

9. 2. 2015

Celkové uznané náklady

2 944 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 944 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč