Alternativní izoformy lyzin demetyláz ve vývoji a nemoci

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 23 (SGA0201900001)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

19-19779S

Název projektu anglicky

Alternative isoforms of lysine demethylases in development and disease

Anotace anglicky

Histone modifications are essential for the correct chromatin function and aberrant levels of these epigenetic marks frequently lead to developmental defects and disease. Thus, the proteins bearing the ability to modify histones have been extensively studied and the molecular mechanisms of their action are now well understood. However, little attention has been paid to alternative isoforms of chromatin modifying proteins. In the proposed project we will focus on KDM2A and KDM2B, the only two lysine demethylases that have been described so far to have an alternative isoform lacking the N-terminal demethylase domain. We will characterize these alternative isoforms, their promoters, protein partners and target genes. Since KDM2A, KDM2B and their alternative isoforms are highly expressed in mouse embryonic stem cells and during their differentiation, we will use mouse stem cells as our model system besides the standard human and mouse cell lines. The proposed project will thus shed more light on the molecular mechanisms behind pluripotency and differentiation of stem cells.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10601 - Cell biology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EA - Morfologické obory a cytologie

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešitel projektu deklaroval dosažení originálních výsledků v analýze promotorů, targetové specifity a deleční analýzy alternativních izoforem histonových demetyláz KDM2A/B. Publikovány ovšem byly pouze výsledky o vlivu na signalizační dráhu wnt. Projektu lze udělit absolutorium byť výsledky byly komunikovány jen částečně. Čerpání prostředků grantu nevykazuje zásadní závady.

Zahájení řešení

1. 1. 2019

Ukončení řešení

31. 12. 2021

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

12. 5. 2021

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP22-GA0-GA-U

Datum dodání záznamu

29. 6. 2022

Celkové uznané náklady

7 476 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 407 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

69 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč