Regulace liniové determinace krvetvorné kmenové buňky chromatin-remodelačním enzymem Smarca5 (Snf2h) v myším modelu.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / 1. lékařská fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P305-12-1033

Název projektu anglicky

Regulation of hematopoietic stem cell differentiation by chromatin remodeling SWI/SNF2 ATPase Smarca5 (Snf2h) in mouse.

Anotace anglicky

Chromatin remodeling plays a key role in transcription, replication and gene repair by utilizing energy-dependent mechanisms such as sliding of DNA in respect to histones or by nucleosome assembly. Smarca5 (Snf2h) represents critical and indispensable chromatin remodeling ATPase that is highly expressed and required for hematopoietic differentiation (Stopka 2000, 2003). Gene knockout of Smarca5 blocks gastrulation in early embryo (Stopka 2003). We therefore created conditional Smarca5 (cKO) mouse model and our preliminary data indicate that in hematopoietic cells its deletion leads to block of stem cell differentiation and lineage commitment; stem cells are preserved and the animals die due to severe anemia day E18. Global gene expression profiles identified differentiation blockade signature and activation of several key pathways. Furthermore, cell type specific (lymphoid, myeloid or erythroid) deletion of Smarca5 display cell maturation blockade and distinct functional defects. This project aims to elucidate role of chromatin structure during hematopoietic development.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

FD - Onkologie a hematologie

CEP - další vedlejší obor

ED - Fyziologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)<br>30204 - Oncology<br>30205 - Hematology

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešení projektu pomocí manipulace s ISWI ATPasou Smarca5 vedlo k významnému posunu v pochopení role struktury chromatinu a odhalilo jak Smarca5 moduluje strukturu chromatinu. Výsledky odhalily významnou úlohu Smarca5 při regulaci methylace DNA v hematopese a buněčné diferenciaci, významně posunuly naše poznání a přinesly řadu kvalitních publikací.

Zahájení řešení

1. 1. 2012

Ukončení řešení

31. 12. 2016

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

17. 3. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP17-GA0-GA-U/03:1

Datum dodání záznamu

28. 6. 2017

Celkové uznané náklady

14 550 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

14 550 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč