Regulují asociované bakterie v interakci s metabolity populace prachových roztočů?
Cíle projektu
Předpokládáme, že za kolaps populací prachových roztočů jsou zodpovědné s nimi asociované bakterie v kombinaci s odpadním metabolitem dusíku guaninem. V různých fázích vývoje populací roztočů v čase budeme studovat bakteriom, produkci antibakteriálních a dalších interagujících proteinů, zásobní látky a zdravotní stav roztočů. Zaměříme se na studium různých populací laboratorních kultur dvou druhů prachových roztočů Dermatophagoides pteronyssinus a D. farinae ve fázích růstu a kolapsu. Dále navodíme uměle fázi kolapsu přidáním bakteriálního izolátu anebo metabolitu guaninu. Metodický přístup zahrnuje bezgelovou a gelovou proteomickou analýzu změn v roztočích využívající námi konturované databáze z genomu a transkriptomu, identifikaci bakterií pomocí nových metod sekvenování, mikroanatomickou lokalizaci bakterií, sledování populačního růstu roztočů, stanovení lipidů, glykogenu, sacharidů a proteinů a metabolitu guaninu. Projekt přinese nové poznatky o interakci mezi bakteriemi, metabolitem a roztoči, a také nové identifikované bakterie a popsané proteiny. Výstupy bude 5 publikací.
Klíčová slova
Dermatophagoidesbacteriainteractionfeedingantibacterial proteins
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Hlavní účastníci
Národní centrum zemědělského a potravinářského výzkumu, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
17-12068S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Are the associated bacteria and waste metabolite responsible for the decline of populations house dust mites?
Anotace anglicky
We hypothesize that mite-associated bacteria and the waste metabolite guanine inhibit the population growth of house dust mites, resulting in a population decline. In the various dust mite growth phases, we will study the bacteriome, the production of antibacterial and other interacting proteins, nutrient contents and mite fitness. We will compare these parameters in different populations of Dermatophagoides pteronyssinus and D. farinae during the growth phases and decline phase of mite culture. Next, we will induce the decline phase by adding a bacteria isolate or the metabolite guanine. This methodical approach combines gel-free and gel-based proteomics utilizing genome and transcriptome databases, bacterial identification through next-generation sequencing, microanatomical bacteria localization, comparisons of population growth, assessment of lipids, glycogen, saccharides and proteins, and the metabolite guanine. This project will result in new knowledge of house mite bacterial and metabolite interactions and new bacterial identifications. The output will be published in 5 papers.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EG - Zoologie
CEP - vedlejší obor
EH - Ekologie – společenstva
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory
(dle převodníku)10613 - Zoology
10614 - Behavioral sciences biology
10615 - Ornithology
10616 - Entomology
10618 - Ecology
10619 - Biodiversity conservation
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Projekt řeší problematiku roztočů domácího prachu, D. pteronyssinus and D. farinae a roli jejich mikrobiomu (bakterie, houby, kvasinky) na jejich populační charakteristiky (početnost, populační růst aj.) a produkci alergenů, kterých je řada a jsou např. závislé na pohlaví. Vysoce hodnotné poznatky jsou shrnuty v šesti článcích a dvou manuskriptech.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2017
Ukončení řešení
31. 12. 2019
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
4. 4. 2019
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP20-GA0-GA-U/02:1
Datum dodání záznamu
23. 7. 2020
Finance
Celkové uznané náklady
4 103 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
3 125 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
978 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
4 103 tis. Kč
Statní podpora
3 125 tis. Kč
76%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
CEP
EG - Zoologie
Doba řešení
01. 01. 2017 - 31. 12. 2019