Chybějící souvislosti: evoluce genomu v tribu Camelineae (brukvovité)
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 21 (SGA0201700001)
Hlavní účastníci
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
17-13029S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Missing links: genome evolution in the tribe Camelineae (Brassicaceae)
Anotace anglicky
The tribe Camelineae (CAMEL; 32 species in 8 genera) is the most scientifically important group of the mustard family (crucifers, Brassicaceae), harbouring the model genus Arabidopsis. Besides several model species, the tribe also contains important weed species and the sequenced genome of Camelina sativa (an emerging biofuel crop). Despite its importance, genomes of several CAMEL species remain unexplored or are virtually unknown. Surprisingly little is known about the origin and genome evolution of the neglected or unknown members of CAMEL. Our project aims to characterize the missing links between the well-known and unknown CAMEL genomes by reconstructing the genome evolution of the whole tribe and its sister clades. We intend, by comparative cytogenomic and phylogenetic approaches, to (re)construct comparative cytogenomic maps and ancestral genomes, identify mechanisms of genome alterations, and to reconstruct phylogenetic relationships within CAMEL and its sister tribes. Our results will initiate follow-up translational research (new models) and whole-genome sequencing projects.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EF - Botanika
CEP - vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Jedná se o excelentní projekt, jehož výsledky byly publikovány formou pěti kvalitních publikací. Identifikace genomu komerčně významné plodiny lničky seté byla publikována v prestižním časopise The Plant Cell a tato studie získala i mediální ohlas.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2017
Ukončení řešení
31. 12. 2019
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
10. 4. 2019
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP20-GA0-GA-U/02:1
Datum dodání záznamu
23. 7. 2020
Finance
Celkové uznané náklady
5 441 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
5 441 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč