Časová a prostorová charakterizace replikace příbuzných rostlinných druhů s kontrastní velikostí genomů

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 21 (SGA0201700001)

Hlavní účastníci

Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

17-14048S

Název projektu anglicky

Spatial and temporal characterization of DNA replication in phylogeneticaly related plant species with contrasting genome sizes

Anotace anglicky

DNA replication is a fundamental process required for growth and development of all eukaryotes. Genetic information is replicated during S phase of cell cycle under strict control to ensure that the replication occurs only once per cell cycle. Although the basic mechanisms of genome replication are conserved, there are differences between plants and animals. Unfortunately, to date DNA replication has been analyzed only in a few plant species. This project aims to provide new insights into DNA replication in two phylogenetically related plant species differing in genome size, including the organization of this important process in 3D nuclear space and elucidation of the relationship between transcriptional activity of DNA sequences and their replication. Replication timing of collinear genic regions will be examined in barley, which possesses large genome comprising ~80% of repetitive DNA sequences and in Brachypodium with a small genome, using multidisciplinary approaches including flow cytometry, molecular cytogenetics, 3D microscopy, next generation sequencing and bioinformatics.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Zahájení řešení

1. 1. 2017

Ukončení řešení

31. 12. 2021

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

10. 4. 2019

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GA-R/13:1

Datum dodání záznamu

22. 2. 2021

Celkové uznané náklady

5 198 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

4 463 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

735 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč