Identifikace a porovnání miRNA signatur v plazmě a ve stolici pacientů s nádory tlustého střeva a konečníku metodou skevenování nové generace

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 21 (SGA0201700001)

Hlavní účastníci

Fakultní nemocnice Plzeň<br>Fakultní Thomayerova nemocnice<br>Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

17-16857S

Název projektu anglicky

Identification and comparison of plasma/stool miRNA signatures in colorectal cancer by next generation sequencing

Anotace anglicky

Dysregulated expression of microRNAs (miRNAs) has been observed in many tumors including colorectal cancer (CRC), revealing that these molecules may be potential diagnostic tools. Interestingly, miRNAs can be isolated in plasma and stool, but a comparison between profiles in these surrogate tissues has not been done yet. In this project, miRNA expression profiles will be characterized by next-generation sequencing and analyzed by a systems biology approach in plasma and stool samples of patients with newly diagnosed CRC or with precancerous lesions and healthy controls at the time of colonoscopy. Concomitant analyses in both biological specimens are aimed at identifying a potential miRNA signature capable of discriminating average risk individuals. Selected relevant miRNAs in plasma/stool will be validated in additional group of subjects with similar clinical characteristics and related to dietary and lifestyle factors. Stool and plasma miRNA markers could provide a powerful non-invasive and sensitive tool in the early detection of CRC and might aid in setting-up screening strategies

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Řešení projektu probíhalo v souladu se záměry projektu. Všechny dílčí cíle byly splněny. Autoři popsali miRNA profily ve stolici a tělních tekutinách. Tyto profily rovněž korelovaly s vybranými klinicko-patologickými charakteristikami kolorektálního karcinomu. Řešení projektu umožnilo vznik 12 impaktovaných prací (mj. Nature Medicine či mSystems).

Zahájení řešení

1. 1. 2017

Ukončení řešení

31. 12. 2019

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

12. 7. 2019

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP20-GA0-GA-U/02:1

Datum dodání záznamu

23. 7. 2020

Celkové uznané náklady

7 762 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

7 657 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

105 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč