Dynamika chromozomu Y u dvoudomých rostlin: vnitro- a mezidruhová analýza genomů Silene latifolia a S. dioica

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 22 (SGA0201800001)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

18-06147S

Název projektu anglicky

Y chromosome dynamics in dioecious plants: intra- and interspecies genomic analysis of Silene latifolia and S. dioica

Anotace anglicky

Structurally diverged sex chromosomes have evolved in many animals as well as in some plants. Sex chromosomes represent a specific genomic region(s) with locally suppressed recombination. As a consequence, repetitive DNA accumulates on the Y (W) chromosomes. There are few studies showing how different types of repeats contribute to genome size dynamics in the context of sex chromosome evolution. We intend to investigate Y chromosome structure in selected populations in two closely related dioecious species, Silene latifolia and S. dioica. Using flow cytometry, NGS analysis and bioinformatics, we will investigate which elements are major players in genome size variability and Y chromosome expansion. Our data will be confirmed by direct Y chromosome sequencing and FISH analysis. The intra- and interspecies differences in repeat distributions both in the genome and in the Y chromosome context will shed light on evolutionary forces that regulate genome size dynamics. We will show if the Y chromosome is still expanding or if it has already started its shrinkage phase.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10611 - Plant sciences, botany

OECD FORD - vedlejší obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

OECD FORD - další vedlejší obor

10620 - Other biological topics

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

CE - Biochemie<br>EB - Genetika a molekulární biologie<br>EF - Botanika

Zahájení řešení

1. 1. 2018

Ukončení řešení

31. 12. 2020

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

25. 3. 2020

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP21-GA0-GA-R/11:1

Datum dodání záznamu

22. 2. 2021

Celkové uznané náklady

9 565 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

8 578 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

987 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč