Silenka nadmutá jako model komparativní genomiky pro rod Silene

Poskytovatel

Akademie věd České republiky

Program

Juniorské badatelské grantové projekty

Veřejná soutěž

Juniorské badatelské grantové projekty 7 (SAV02009-B)

Hlavní účastníci

—

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

KJB600040901

Název projektu anglicky

Establishment of Silene vulgaris as a model for comparative genomics in genus Silene

Anotace anglicky

Silene vulgaris (bladder campion) with its relatively small genome represents an important model in plant genetics, biochemistry and evolutionary and population biology. Unfortunately, neither genomic resources nor comprehensive sequence information areavailable. We suggest to establish S. vulgaris as a basic comparative genomic model in genus Silene. The newly constructed BAC library will be used as a tool for comparative cytogenetics not only for S. vulgaris itself but also for closely related dioecius species with sex chromosomes. Isolation and analysis of BAC clones of corresponding autosomal and sex linked regions will enable us to decipher how sex chromosomes evolved. Comparison of repetitive DNA database with similar databases available for S.latifolia will show which DNA elements play a role in genome expansions and which ones in sex chromosome evolution. The project will be realized in collaboration with the Institute of Integrative Biology (ETH, Zürich, Switzerland).

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Během řešení projektu bylo vytvořeno několik genomových zdrojů a databází pro druh Silene vulgaris. Hlavními přínosy je vytvoření BAC knihovny, srovnání autozomálních oblastí chromozomů s pohlavně vázanými a porovnání genomů příbuzných druhů rodu Silene.

Zahájení řešení

1. 1. 2009

Ukončení řešení

31. 12. 2011

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

18. 3. 2011

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP12-AV0-KJ-U/01:1

Datum dodání záznamu

25. 5. 2012

Celkové uznané náklady

2 530 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 530 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč