Evoluce pohlavních chromozomů - chromozomálně specifická genomika u rodu Silene

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.<br>Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

P501-12-2220

Název projektu anglicky

Sex chromosome evolution - chromosome-specific genomics in genus Silene

Anotace anglicky

In contrast to animals with mostly separated two sexes, a number of reproductive strategies coexist in higher plants. Surprisingly, the presence of well-established sex chromosomes in dioecious plants is rare. We intend to investigate structure and evolution of sex chromosomes in dioecious plant Silene latifolia. Since only limited sequence information on sex chromosomes is available in this species we focus on characterization of X chromosome as the fundamental step towards understanding the evolution of sex chromosomes. Our first goal is to construct X chromosome-specific BAC library using flow sorting approach. Subsequently, X chromosome specific physical map will be assembled and individual BACs will be sequenced. In parallel, massive sequencing using sorted X and Y chromosomes and sex chromosome-corresponding BAC clones in gynodioecious S. vulgaris will be carried out. Expression data for individual tissues, sexes and species will be generated based on RNA-seq approach. Comparative analyses of the data obtained will improve our understanding of processes forming sex chromosomes.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - vedlejší obor

EF - Botanika

CEP - další vedlejší obor

ED - Fyziologie

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

1. Výsledky projektu významně posunuly naše znalosti o degenerativních procesech pohlavních chromosomů dvoudomých rostlin. Degenerace chromosomu Y je zpomalována obrannými mechanismy. 2. Údaje řešitele jsou adekvátní. 3. Šlechtitelství (např. chmel, konopí); účast PhD studentů. 4. Výstupem je 11 publikací - vynikající hodnocení. 5. Nedostatky nebyly shledány.

Zahájení řešení

1. 1. 2012

Ukončení řešení

31. 12. 2016

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

12. 4. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP17-GA0-GA-U/03:1

Datum dodání záznamu

28. 6. 2017

Celkové uznané náklady

14 938 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

14 938 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč