Konstrukce BAC knihovny Silene latifolia a její využití

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Construction of Silene latifolia BAC library and its application

Anotace anglicky

Project is focused on construction and the use of BAC (bacterial artificial chromosome) library of white campion (Silene latifolia, syn. Melandrium album). This library would represent the first BAC library of a dioecious plant as well as a dicot plant possessing a large genome. S. latifolia is a favourite model species for studies of sex determination and evolution of sex chromosomes in plants. At present, BAC libraries represent a unique tool for structural, functional, and evolutionary genomics. In library construction we will use the modern molecular-biology approaches including the use of robots to prepare as large BAC library of best quality as possible. The quality will be tested by determining the average insert length by PFGE. The BAC clones especially suitable for fluorescence in situ hybridisation studies (FISH) will be selected. The aim of FISH experiments is to localize already known genes as well as general study of chromosomal distribution of genes in S. latifolia. In gene distribution

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

GE - Šlechtění rostlin

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Silene latifolia je nejpoužívanějším modelem studia determinace pohlaví a pohlavních chromosomů u rostlin. BAC knihovny jsou mocným nástrojem současné genomiky umožňujícím mapování komplexních genomů. V rámci řešení grantu jsme zkonstruovali a charakteri

Zahájení řešení

1. 1. 2002

Ukončení řešení

1. 1. 2004

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP/2005/GA0/GA05GA/U/N/B:7

Datum dodání záznamu

2. 6. 2008

Celkové uznané náklady

3 774 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

2 389 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

1 385 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč