Od konformace po biologické funkce proteinu HP1
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Hlavní účastníci
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
18-07384S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
From conformation to biological functions of HP1 protein
Anotace anglicky
During cell differentiation and DNA repair processes, changes in post-translation modifications and conformation properties of heterochromatin protein 1 (HP1) are expected. These changes, determined by epigenetic events, will be analyzed by theoretical approaches using computational chemistry and mass spectrometry (MS). On the other hand, fluorescent properties of HP1 in time will be studied experimentally by means of FLIM-FRET microscopy as well as biological functions of HP1 proteins with different FLIM characteristics. Three variants of HP1 protein (HP1α, HP1β, HP1γ) as well as possible homodimers or heterodimers between HP1 variants will be investigated. The goal will be to show functions of HP1 proteins from the point of view of gene activity or gene silencing during differentiation or DNA repair. Epigenetic properties of individual domains of HP1 proteins, derived from theoretical calculations, their modifications determined by MS and conformational arrangements, will be correlated with biological functions accompanying changes of gene activity.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10601 - Cell biology
OECD FORD - vedlejší obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - další vedlejší obor
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
AF - Dokumentace, knihovnictví, práce s informacemi<br>BC - Teorie a systémy řízení<br>BD - Teorie informace<br>CE - Biochemie<br>EA - Morfologické obory a cytologie<br>EB - Genetika a molekulární biologie<br>IN - Informatika
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2018
Ukončení řešení
31. 12. 2020
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
24. 4. 2020
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP21-GA0-GA-R/18:1
Datum dodání záznamu
27. 2. 2021
Finance
Celkové uznané náklady
10 461 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
8 850 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
1 611 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč