Úloha epigenetických procesů při reparaci DNA
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 17 (SGA0201300005)
Hlavní účastníci
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
13-07822S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
The role of epigenetic processes in DNA repair
Anotace anglicky
Every day, genomes are insulted by genetoxic stress that causes DNA damage. Disorders in DNA composition initiate DNA repair machinery leading to healing of damaged chromatin. During evolution, multiple DNA damage repair mechanisms were developed. Thus, we decided to study DNA damage responses (DDRs) in different cell types, including histone methyltransferases SUV39h double null (dn) and H2AX (dn) fibroblasts. These cells will be exposed to different experimental stimuli, including inhibitors of histone acetyltransferases (HATs) and histone deacetylases (HDACs) and then DNA damage will be induced. We will study recruitment of epigenetically important proteins, such as HP1 (HP1 beta, ΔCD HP1beta, and ΔCSD HP1beta) and BMI1, to UV-induced DNA lesions. Moreover, interaction between proteins of interest will be tested by FRET technique. An immense effort will be directed towards analysis of γH2AX and 53BP1 status in spontaneously occurring DNA lesions of entire genome and in compartment of nucleoli. Results of our experiments should imply which epigenetic events play a role in DDRs.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
CEP - hlavní obor
EA - Morfologické obory a cytologie
CEP - vedlejší obor
EB - Genetika a molekulární biologie
CEP - další vedlejší obor
—
OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Hodnocení dokončeného projektu
Hodnocení poskytovatelem
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Zhodnocení výsledků projektu
Výsledky projektu, zaměřeného na studium epigenetických procesů s akcentem na post-translační modifikace histonů (acetylace a metylace histonu H3), ukázaly nové mechanismy, které se uplatňují při DNA opravách. Výsledky byly publikovány v 18 publikacích. Projekt nevykazuje nedostatky v dodržování grantových pravidel nebo čerpání finančních prostředků.
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 2. 2013
Ukončení řešení
31. 12. 2016
Poslední stav řešení
U - Ukončený projekt
Poslední uvolnění podpory
5. 4. 2016
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Datum dodání záznamu
28. 6. 2017
Finance
Celkové uznané náklady
9 516 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
9 516 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč