Analýza interakcí mezi polyvalentním terapeutickým fágem druhu Twort-like a jeho hostitelem Staphylococcus aureus
Cíle projektu
Polyvalentní bakteriofágy druhu Twort-like jsou uznávány jako vhodné terapeutické agens proti stafylokokovým infekcím už od dob jejich objevu v 20. letech minulého století. Pro jejich terapeutické využití a schválení fágové terapie jako bezpečné metody, je nutná detailní znalost jejich molekulárně-biologického mechanismu infekce bakteriální buňky. Tyto fágy jsou předmětem intenzivního výzkumu, který se týká rozmezí hostitele, analýzy genomu a strukturních studií. V rámci předkládaného projektu navrhujeme monitorování průběhu fágové infekce hostitelských buněk pomocí analýzy transkriptomu, studia příčin fágové polyvalence, objasnění příčin rezistence některých kmenů k bakteriofágům a analýzu exprese fágových proteinů. V projektu budou použity metody sekvenování nové generace, kam patří RNAseq vhodná pro analýzu transkriptomu, molekulárně-biologické postupy jako transpozonová mutageneze a editace genomu. Výsledky projektu přispějí k popisu interakcí mezi fágem a hostitelem, jejichž porozumění je nezbytné před využitím fágové terapie.
Klíčová slova
bacterial virusesStaphylococcusbacteriophagetranscriptomegenome editingbiological therapy
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Hlavní účastníci
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
18-13064S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Analysis of interactions between polyvalent Twort-like therapeutic phage and its host Staphylococcus aureus
Anotace anglicky
Polyvalent Twort-like bacteriophages are utilized as a useful therapeutic agent against staphylococcal infections since their discovery in the 20’s of the last century. However, approval of bacteriophage therapy as a safe method requires detailed knowledge of the molecular biological mechanisms of viral infection of bacterial cells. These phages are the subject of intensive research, regarding the host range, comparative genomics and structural studies. We propose to monitor the course of phage infection of host cells using transcriptome analysis, the study of the causes of phage polyvalence, clarifying the causes of resistance to certain strains to bacteriophages and phage protein expression analysis. The next-generation sequencing methods, which include co-infection RNAseq analysis suitable for transcriptome study, molecular biology techniques such as transposon mutagenesis and genome editing will be used. The results of the project will contribute to understanding the interactions between phage and host that is necessary for put the phage therapy into the practice.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10606 - Microbiology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)EE - Mikrobiologie, virologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2018
Ukončení řešení
31. 12. 2022
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
24. 4. 2020
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP22-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
22. 2. 2022
Finance
Celkové uznané náklady
7 793 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
7 052 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
741 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
7 793 tis. Kč
Statní podpora
7 052 tis. Kč
90%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
OECD FORD
Microbiology
Doba řešení
01. 01. 2018 - 31. 12. 2022