Integrovaná analýza genomu a proteomu terapeuticky významných bakteriofágů kombinací elektroforézy a hmotnostní spektrometrie

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

—

Název projektu anglicky

Integrated genome and proteome analysis of therapeutically important bacteriophages by combination of electrophoresis and mass spectrometry

Anotace anglicky

It is expected that selected bacteriophages (bacterial viruses), or even their specific proteins and/or peptides can be used as new effective means to treat bacterial infections. For a rational development of phage therapy, without the adverse effects ofcurrent antibiotics, the relationship between desired biological properties of suitable phages and their genome/proteome structure must be found. To achieve this goal it is necessary to find new technologies for rapid analysis of the phage molecularstructure. In this project, we will develop a three-dimensional separation system for analysis and typing of the phage proteome. First, micropreparative capillary electrophoresis with laser-induced fluorescence detection (LIF) and noncovalent labelingwill beused for the separation of the phage proteins. This fingerprint will be used to trace differences in protein content of phages and to control the automated fraction collection. The resulting fractions will be digested by trypsin immobilized

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

CB - Analytická chemie, separace

CEP - vedlejší obor

EB - Genetika a molekulární biologie

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10406 - Analytical chemistry<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Srovnání sekvencí DNA polyvalentního stafylokokového fága 812, jeho mutant a příbuzných fágů vedlo k odhalení a následně pak k podrobné charakterizaci mutačních změn fágového genomu, majících přímou souvislost s jejich rozmezím hostitelů. Významným výsle

Zahájení řešení

1. 1. 2003

Ukončení řešení

1. 1. 2005

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

—

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP06-GA0-GA-U/07:6

Datum dodání záznamu

15. 1. 2009

Celkové uznané náklady

7 442 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

3 890 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

3 552 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč