Replikace fágů v bakteriálním biofilmu

Poskytovatel

Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy

Program

ERC CZ

Veřejná soutěž

SMSM2019LL001

Hlavní účastníci

Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

MSMT-35696/2019-1

Název projektu anglicky

Phage replication in bacterial biofilm

Anotace anglicky

"When Staphylococcus aureus cells form a biofilm in the human body they become shielded from the immune system and highly resistant to antibiotics. Current therapeutic options against biofilms are limited to the long-term application of a combination of several antibiotics in high doses or the surgical removal of infected tissues. We propose to study the mechanisms that phages from the family Myoviridae, natural predators of bacteria, have evolved to infect biofilms to identify new strategies for the development of antimicrobial compounds or phage therapy. We will use focused ion beam milling and cryo-electron tomography to analyze the effect of phage infection on the integrity of a biofilm matrix. We will determine the function of bacterial proteins in phage genome delivery, the structure of phage replication “factories”, and the role of chaperones and host membranes in phage assembly. We will use fluorescence microscopy to characterize the relationship between the stage of biofilm development and its sensitivity to phage infection. We will measure the efficiency and duration of the phage replication cycle in dormant and persister bacteria within a biofilm and determine whether S. aureus cells in a biofilm employ a communal defense against phages. Major innovations in our approach will include the determination of high-resolution structures of phage macromolecular complexes using cryo-electron microscopy and tomography of cell sections, the use of CRISPR/Cas9 for the modification of phage genomes, and time-lapse light sheet fluorescence microscopy to observe the spread of phage infection within a biofilm. The biological significance of this proposal lies in its focus on understanding phage-bacteria interactions under clinically relevant conditions.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10606 - Microbiology

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EE - Mikrobiologie, virologie

Hodnocení poskytovatelem

V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt Fágová infekce bakteriálního biofilmu, podpořený z programu ERC-CZ, byl zaměřen na charakterizaci struktury a procesu infekce fágy infikujícími patogenní a vůči antibiotikům rezistentní bakterie. Nejvýznamnějším výsledkem je popis fága SU10 publikovaný v časopise Nature Communications. Biologický význam tohoto projektu spočívá v jeho zaměření na dosud nepopsané interakce fágů a bakterií za biologicky a klinicky relevantních podmínek.

Zahájení řešení

1. 1. 2020

Ukončení řešení

31. 12. 2022

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

4. 5. 2022

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP23-MSM-LL-U

Datum dodání záznamu

30. 6. 2023

Celkové uznané náklady

35 299 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

35 299 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč