Multirezistentní vysoce rizikové linie Escherichia coli: příběh úspěšné souhry mezi chromozomem a plazmidem
Cíle projektu
Extraintestinálně patogenní Escherichia coli (ExPEC) je významným původcem závažných onemocnění člověka a zvířat. Rostoucí rezistence ExPEC kmenů ke kriticky důležitým skupinám antimikrobiálních látek má obrovské dopady na veřejné zdraví, zemědělství a světovou ekonomiku. V rámci tohoto projektu budou identifikovány znaky klinicky relevantních ExPEC kmenů pocházejících z různých zdrojů (lidé, zvířata, prostředí) s využitím konceptu jednoho zdraví a celogenomového sekvenování. Sledována bude celková diverzita těchto kmenů, přítomnost antibiotické rezistence, virulence a specifických skupin plazmidů. Studován bude význam plazmidů, jejich stabilita, schopnost přenosu a vzájemné vztahy s genomem hostitelské bakterie. Budou odhaleny interakce mezi plazmidem a hostitelskou buňkou vedoucí ke ko-evoluci genetické informace, jakožto klíčového parametru zodpovědného za úspěch specifických ExPEC linií. Výsledky projektu umožní pochopit cesty šíření ExPEC mezi různými nikami, odhalí jejich celkovou diverzitu, společné vlastnosti, charakteristické vazby s virulencí a rezistencí k antibiotikům.
Klíčová slova
resistanceantibioticsEscherichia coliplasmidsmolecular epidemiologywhole genome sequencingOne Health Approach
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
Standardní projekty 22 (SGA0201800001)
Hlavní účastníci
Veterinární univerzita Brno / CEITEC - Středoevropský technologický institut, VFU Brno
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
18-23532S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Multiresistant high-risk Escherichia coli lineages: a success story of the chromosome and plasmid interplays
Anotace anglicky
Extraintestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) is an important cause of severe infections in humans and animals. Increasing resistance of ExPEC to critically important antimicrobials has a huge impact on public health, agriculture and world economics. In this project, traits of clinically relevant ExPEC from diverse sources (humans, animals, environment) will be identified using One Health Approach and whole genome sequencing. The overall diversity of the strains as well as the presence of antibiotic resistance, virulence and specific plasmids will be evaluated. The role of plasmids, their stability, transfer and relationships with bacterial genome will be studied. Interplays between plasmid and genome of host bacteria leading to co-evolution of genetic information as a key parameter for the success of some ExPEC lineages will be revealed. The project results will help to understand the transmission routes of ExPEC between different niches, it will demonstrate their diversity, common features as well as characteristic interactions with virulence and antibiotic resistance.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10606 - Microbiology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)EE - Mikrobiologie, virologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2018
Ukončení řešení
31. 12. 2020
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
25. 3. 2020
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP21-GA0-GA-R/15:1
Datum dodání záznamu
24. 2. 2021
Finance
Celkové uznané náklady
10 660 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
10 660 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
10 660 tis. Kč
Statní podpora
10 660 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
OECD FORD
Microbiology
Doba řešení
01. 01. 2018 - 31. 12. 2020