Evoluce velikosti genomu - centromerický drajv v nové roli
Cíle projektu
Zachování poměru velikostí chromozomů („zavazadel“) a jejich kinetochorů („držadel“), by mělo znamenat, že divergence velikostí kinetochorů, způsobená centromerickým drajvem, se odrazí v divergenci velikosti chromozomů živočichů a semenných rostlin a naopak v její stagnaci u hub, kapradin, plavuní a mechorostů, u nichž drajv neprobíhá. Tento dosud přehlížený vliv centromerického drajvu na velikost chromozomů a celých genomů chceme testovat srovnáváním tempa evoluce a divergence velikosti chromozomů u těchto linií eukaryot. Korelaci velikostí kinetochorů a chromozomů napříč druhy i uvnitř karyotypů budeme testovat u vybraných linií krytosemenných rostlin měřením imunofluorescenčně barvených kinetochorů jak na mitotických chromozomech, tak flow-cytometricky v interfázních jádrech (nová metoda), v kombinaci s pokročilými technikami chromozomálního paintingu. U linií krytosemenných s vysokým a nízkým tempem evoluce velikosti chromozomů budeme srovnávat selekční režimy působící na gen kinetochorového proteinu CENH3, abychom přímou souvislost s drajvem prokázali.
Klíčová slova
angiospermsasymmetric meiosiscentromere drivechromosome paintingchromosome sizeeukaryotesflow cytometrygenome size evolutionkaryotype evolutionkinetochore size
Veřejná podpora
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
Program
Standardní projekty
Veřejná soutěž
SGA0202000001
Hlavní účastníci
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Druh soutěže
VS - Veřejná soutěž
Číslo smlouvy
20-15989S
Alternativní jazyk
Název projektu anglicky
Evolution of genome size - a new role for the centromere drive
Anotace anglicky
Maintaining the size ratio of chromosomes (“luggage”) and their kinetochores (“handles”) should mean that the kinetochore size divergence caused by centromere drive is reflected in the divergence of the chromosome size in animals and seed plants and, conversely, in chromosome size stasis in fungi, ferns, lycophytes and bryophytes, where the drive is absent. This so far unrecognized effect of centromere drive on the size evolution of chromosomes and entire genomes is to be tested by comparing the divergence and rates of chromosome size evolution in these eukaryotes. We will test the correlation of kinetochore and chromosome sizes across species and within karyotypes in selected angiosperm lineages by measuring immuno-stained kinetochores on mitotic chromosomes and flow-cytometrically in interphase nuclei (new method) in combination with advanced techniques of chromosome painting. In angiosperm lineages with high and low rates of chromosome size evolution, we will compare the selection regimens acting on the kinetochore protein/gene CENH3 to test a direct link to the centromere drive.
Vědní obory
Kategorie VaV
ZV - Základní výzkum
OECD FORD - hlavní obor
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
OECD FORD - vedlejší obor
—
OECD FORD - další vedlejší obor
—
CEP - odpovídající obory
(dle převodníku)EA - Morfologické obory a cytologie
Termíny řešení
Zahájení řešení
1. 1. 2020
Ukončení řešení
30. 6. 2023
Poslední stav řešení
—
Poslední uvolnění podpory
1. 4. 2023
Dodání dat do CEP
Důvěrnost údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Systémové označení dodávky dat
CEP24-GA0-GA-R
Datum dodání záznamu
21. 5. 2024
Finance
Celkové uznané náklady
8 866 tis. Kč
Výše podpory ze státního rozpočtu
8 866 tis. Kč
Ostatní veřejné zdroje financování
0 tis. Kč
Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.
0 tis. Kč
Základní informace
Uznané náklady
8 866 tis. Kč
Statní podpora
8 866 tis. Kč
100%
Poskytovatel
Grantová agentura České republiky
OECD FORD
Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Doba řešení
01. 01. 2020 - 30. 06. 2023