Cirkulární RNA a jejich vztah k sestřihu RNA v patogenezi myelodysplastického syndromu

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202000001

Hlavní účastníci

Ústav hematologie a krevní transfúze

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

20-19162S

Název projektu anglicky

Circular RNAs and their relation to RNA splicing in the pathogenesis of myelodysplastic syndromes

Anotace anglicky

Mutations in RNA splicing factors represent the most common molecular alterations in myelodysplastic syndromes (MDS). Despite some advances in the understanding of their roles in MDS pathogenesis, the impact of mutated splicing factors on circular RNAs (circRNAs) has not been studied. CircRNAs constitute a class of RNAs with a covalently closed continuous loop that has recently been discovered to be widespread and abundant. Because most circRNAs are produced by backsplicing, we hypothesize that the aberrant splicing seen in MDS also affects circRNA formation. With respect to the various regulatory functions of circRNAs, their deregulation likely contributes to MDS pathogenesis. Moreover, altered levels of particular circRNAs might serve as new molecular biomarkers for the prognosis and therapeutic response in MDS management. Moreover, circRNAs might form a new class of molecular targets for MDS treatment. In this project, we will use next generation sequencing and perform integrative data analyses and functional studies to identify and characterize circRNA roles in MDS pathogenesis.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

30101 - Human genetics

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EB - Genetika a molekulární biologie

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

V 7 publikacích jsou popsány expresní profily cirkulárních RNA (circRNA) u rozsáhlé skupiny pacientů s různými podtypy myelodysplastického syndromu (MDS) a objasněna nadměrná exprese cirkulárních RNA u osob považovaných za vysoce rizikovéa ncRNA potenciálně ovlivňující účinnost léčby AZA, autoři také vyvinuli model pro anotace cirkRNA na základě jejich interakcí.

Zahájení řešení

1. 1. 2020

Ukončení řešení

30. 6. 2023

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-GA0-GA-U

Datum dodání záznamu

21. 5. 2024

Celkové uznané náklady

9 979 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 687 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

292 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč