Biofyzikální charakterizace guaninových kvadruplexů v RNA genomu viru klíšťové encefalitidy a objasnění jejich role v replikačním cyklu viru

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202000001

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

20-20229S

Název projektu anglicky

Biophysical characterization of guanine quadruplexes in the RNA genome of tick-borne encephalitis virus and elucidating their role in viral life cycle

Anotace anglicky

Guanine quadruplexes (G4) represent structurally diverse group of unusual conformations of nucleic acids. Recently, their occurrence in vivo and some of their cellular roles was reported. RNA quadruplexes are very stable, even in comparison to DNA, which supports their formation in vivo and their involvement in cellular processes. They were reported in some RNA viruses, for example retroviruses or flaviviruses. The Flaviviridae family comprises viruses with single-stranded RNA genome, which are usually responsible for severe neural infections, like tick-borne encephalitis virus (TBEV). In the project, we will identify and, using biophysical techniques, characterize quadruplexes in the TBEV genome. Subsequently, by studying the influence of G4-specific mutants and small-molecule ligands, as well as by direct quadruplex visualisation in the TBEV genome, we will assist in clarifying the role of quadruplexes in the TBEV replication cycle. The data obtained in this project will expand the knowledge of TBEV pathogenesis and might suggest future directions of therapy of TBEV infections.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10610 - Biophysics

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

BO - Biofyzika

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt splnil předpokládané cíle a přinesl nové poznatky o roli guaninových kvadruplexů v RNA genomu viru klíšťové encefalitidy s možnými důsledky pro hledání nových terapeutických metod. Výsledky jsou shrnuty ve 4 impaktovaných publikacích. Během projektu byli vedeny 2 diplomové a 3 disertační práce. Řešení projektu projektu proběhlo v souladu s grantovými pravidly.

Zahájení řešení

1. 1. 2020

Ukončení řešení

30. 6. 2023

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

1. 4. 2023

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP24-GA0-GA-U

Datum dodání záznamu

21. 5. 2024

Celkové uznané náklady

10 753 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

10 753 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč