Regulace faktoru embryonálních kmenových buněk Oct4 prostřednictvím guaninového kvadruplexu v promotoru

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Postdoktorandské granty

Veřejná soutěž

Postdoktorandské granty 15 (SGA0201400003)

Hlavní účastníci

Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

14-33947P

Název projektu anglicky

Regulation of the embryonic stem cell pluripotency factor Oct4 via guanine quadruplex in its promoter

Anotace anglicky

Embryonic stem cells (ES), with their abilities to differentiate into any cell type and to self-renew, represent promising curative tool, useful primarily in a transplantation and regenerative medicine. Formation of ES cells requires activation of the Oct4 gene. Oct4 gene is under regulation of several regulatory regions, which are unusually guanine rich and, thus, may potentially form guanine quadruplexes. These sites are targeted by several transcription factors, such as protein SAF-A. Using UV spectroscopic methods, especially circular dichroism, electrophoretic methods, chemical and enzymatic probing and fluorescence techniques we will study the mechanism by which is the quadruplex involved in the regulation of the Oct4 and, in fact, in an origin and differentiation of ES cells. We will elucidate the interaction of the G-rich region and two DNA-binding domains of the SAF-A protein to elucidate the role of the quadruplex in this interaction; does the quadruplex serve as a conformational switch, dependent on binding of the SAF-A protein and subsequently regulating Oct4 expression?

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

CEP - hlavní obor

BO - Biofyzika

CEP - vedlejší obor

—

CEP - další vedlejší obor

—

OECD FORD - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

10610 - Biophysics

Hodnocení poskytovatelem

U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

Zhodnocení výsledků projektu

Projekt byl řešen na uspokojivé úrovni a přinesl nové poznatky týkajících se regulační role guaninového kvadruplexu při regulaci exprese genu oct4. Výsledky mají širší význam pro mezinárodní vědeckou komunitu. Výstupem projektu jsou 2 články v renomovaných mezinárodních časopisech, BBA (IF5.37) a Biochemie. (IF3.01). Hlavních cílů bylo dosaženo, proto panel přiděluje hodnocení „splněno“.

Zahájení řešení

1. 1. 2014

Ukončení řešení

31. 12. 2016

Poslední stav řešení

U - Ukončený projekt

Poslední uvolnění podpory

17. 3. 2016

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP17-GA0-GP-U/01:1

Datum dodání záznamu

30. 6. 2017

Celkové uznané náklady

1 505 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

1 505 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč