Evoluce repeatomu rostlinných allopolyploidů: analýza diploidně-polyploidního komplexu Chenopodium album agg.

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202000001

Hlavní účastníci

Česká zemědělská univerzita v Praze / Fakulta životního prostředí

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

20-20286S

Název projektu anglicky

Repeatome evolution in plant allopolyploids: An outcome from the diploid-polyploid complex of the Chenopodium album aggregate

Anotace anglicky

Merging two or more genomes in allopolyploid species usually results in extensive modification of the genomes and creates novel expression patterns and regulatory interactions, followed by the development of new phenotypes. One way to define the role of any genomic component is to project its dynamics on the evolution of a known biological system. In this project, we will use Next Generation Sequencing data to analyse the variability of repeatome components (RC) in a phylogenetic context, using as model the diploid-polyploid Chenopodium album aggregate, with already known phylogeny. We will test two alternative hypotheses regarding the evolution of RC in allopolyploid taxa having stable genome size. (1) The genomic stasis hypothesis: This predicts almost perfect additivity of the parental RC. (2) The genome re-patterning hypothesis: This predicts rearrangements and display deviations from the expected pattern of parental RC additivity. This study will shed new light on the genomic and chromosomal re-patterning accompanying hybridisation and polyploidisation events.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10611 - Plant sciences, botany

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EF - Botanika

Zahájení řešení

1. 1. 2020

Ukončení řešení

31. 12. 2022

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

12. 4. 2022

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP23-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

26. 6. 2023

Celkové uznané náklady

9 713 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 713 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč