Genomová duplikace jako nedokonalá speciační bariéra? Evoluční mechanismy a důsledky mezi-ploidní introgrese v přírodních populacích

Poskytovatel

Grantová agentura České republiky

Program

Standardní projekty

Veřejná soutěž

SGA0202000001

Hlavní účastníci

Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta

Druh soutěže

VS - Veřejná soutěž

Číslo smlouvy

20-22783S

Název projektu anglicky

Genome duplication as an imperfect barrier in speciation? Evolutionary drivers and consequences of inter-ploidy introgression in natural populations

Anotace anglicky

Genome duplication (polyploidisation) is a dominant force in sympatric speciation, particularly in plants including many crops. It is usually assumed that polyploidy poses an instant barrier to gene flow between diploid and its polyploid derivative. Our genomic survey, however, demonstrated rampant inter-ploidy gene flow in wild Arabidopsis. Yet mechanisms allowing such genome permeability and its evolutionary consequences remain elusive. Here, we aim to dissect drivers and mechanisms of ploidy barrier in five plant species and test the hypothesis that selection may promote inter-ploidy introgression. Firstly, we will infer mechanisms shaping inter-ploidy barrier by crossing experiments and transcriptomics. Then, we will test if selection shapes the differentiation landscape of admixed polyploid genomes. Finally, we will infer adaptive consequences of inter-ploidy introgression in wild Arabidopsis populations. The results have the potential to shift our perception of polyploidy towards speciation-with-gene-flow scenaria and inform breeding programmes involving polyploid crops.

Kategorie VaV

ZV - Základní výzkum

OECD FORD - hlavní obor

10611 - Plant sciences, botany

OECD FORD - vedlejší obor

—

OECD FORD - další vedlejší obor

—

CEP - odpovídající obory <br>(dle <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">převodníku</a>)

EF - Botanika

Zahájení řešení

1. 1. 2020

Ukončení řešení

31. 12. 2022

Poslední stav řešení

—

Poslední uvolnění podpory

12. 4. 2022

Důvěrnost údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Systémové označení dodávky dat

CEP23-GA0-GA-R

Datum dodání záznamu

26. 6. 2023

Celkové uznané náklady

9 787 tis. Kč

Výše podpory ze státního rozpočtu

9 787 tis. Kč

Ostatní veřejné zdroje financování

0 tis. Kč

Neveřejné tuz. a zahr. zdroje finan.

0 tis. Kč